扁平疣的皮损在皮肤病中是很典型的，也很容易诊断。只要是专业的皮肤科医生，一般都不会诊断错误。所以一般来说，扁平疣的诊断是不需要做实验室检查，用肉眼观察皮损和问诊就可以诊断了。只有扁平疣的皮损很大，超过绿豆大小，这时才需要做病理检查。
扁平疣如何与老年疣相鉴别，扁平疣，是发生在皮肤上的由人类乳头瘤病毒感染而发生的皮肤病，其皮损表现为：光滑质硬扁平丘疹，可突然增多，也可在长期的发病后悄然消失中，遗留色素沉着。老年疣其实质是人体在衰老过程中产生的对人体有害的代谢产物——脂褐质。沉积于皮肤而到。皮损表现：初期为平铺于皮肤上的黑褐色或黄褐色斑片，可慢慢变大或呈疣状增生。疣状增生性的老年疣表面粗糙，疣体上有裂纹将疣体分为数叶。表面较油腻。无论是什么样的老年疣，发生后生长缓慢，但发生后一般不会自已消退 。
扁平疣是一种常见的皮肤病症之一, 扁平疣一般无自觉症状，根据扁平疣皮疹特点即可确诊。扁平疣皮疹为粟粒至高梁米大小的扁平丘疹，为圆形、椭圆形或多角形，边界清楚，表面光滑，呈淡褐色、黄褐色或正常肝色。常对称发生于颜面、手背、前臂等部位，呈散在或密集分布，可因抓搔而发生自身接种。偶感轻度搔痒。
扁平疣相当于中医的扁瘊，是一种多发生于颜面或手背的米粒大小、扁平，稍高起皮面的小疣。扁平疣皮损处呈米粒至高梁粒大小扁平丘疹，表面光滑，孤立散在，淡黄褐色或正常皮肤色，或微痒。
扁平疣和常见的汗管瘤易相混淆，汗管瘤又称汗管囊瘤或汗管囊肿腺瘤。现已证明为一种向汗管分化的小汗腺肿瘤，以常染色体显性遗传方式遗传。汗管瘤的皮肤损害主要分布在眼睑附近，皮疹呈密集分布的淡黄色或肤色丘疹，表面有蜡样光泽，半球形。而扁平疣多发于面颊及手背，皮疹为扁平丘疹。
扁平疣是由人类乳头瘤病毒引起的。大多数都是突然出现，一般为针头至米粒大或稍大的扁平丘疹，呈圆形或不规则形，略高于皮肤表面，也可显著地突起而形成圆顶状。表面光滑，境界清楚，触之较硬，为浅褐或灰白、淡黄或正常皮色。汗管瘤又称汗管囊瘤或汗管囊肿腺瘤。汗管瘤主要在眼睑部位，以下眼睑多见，有一定的遗传倾向。
